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相關(guān)服務(wù)
載體構(gòu)建 
質(zhì)粒DNA制備 
病毒包裝服務(wù) 
mRNA基因遞送解決方案 
CRISPR基因編輯解決方案 
shRNA基因敲低解決方案 

線蟲gRNA表達載體

概述

CRISPR/Cas9(成簇規(guī)則間隔短回文重復(fù)序列/CRISPR相關(guān)蛋白9)系統(tǒng)極大地促進了多種物種的體外和體內(nèi)基因抑制實驗。在細胞內(nèi),Cas9核酸酶與引導(dǎo)RNA(gRNA)形成復(fù)合物,該復(fù)合物通過與基因組中的18-22 nt的同源靶序列直接相互作用提供靶向特異性。gRNA與靶位點通過互補配對使Cas9定位到靶序列上,然后切割基因組中的靶位點。Cas9掃描基因組并切割與gRNA互補的序列,前提是這些序列跟隨著一段NGG前間區(qū)序列鄰近基序(PAM)。雙鏈DNA斷裂隨后被HDR或者NHEJ途徑修復(fù),從而產(chǎn)生不同大小長度的位點突變(堿基插入或缺失)。

使用一個一體化的同時表達Cas9和gRNA的載體,或者分開表達Cas9和gRNA的載體,可以方便地在線蟲中進行CRISPR/Cas9編輯。該載體系統(tǒng)屬于后者,包含一個線蟲密碼子優(yōu)化的U6啟動子驅(qū)動表達的gRNA。該載體可以被注射到線蟲的遠端性腺,然后進入生殖細胞細胞核。使用該載體注射的線蟲可以表達Cas9。篩選突變后代,獲得突變可遺傳的基因敲除線蟲品系。

關(guān)于該載體系統(tǒng)的更新信息,請參考以下文獻。

參考文獻主題
Genetics. 202:885 (2016)DNA transformation in C. elegans
Curr Protoc Mol Biol. 129 (2019)CRISPR/Cas9 vectors in C. elegans
Nat Methods. 10:741 (2013)gRNA design for C. elegans
亮點

通過在載體骨架上整合進人工合成的啟動子近側(cè)內(nèi)含子序列,我們的載體經(jīng)過優(yōu)化可以在線蟲中高效表達轉(zhuǎn)基因。

優(yōu)勢

技術(shù)簡單:使用顯微注射即可把質(zhì)粒轉(zhuǎn)入細胞,相比起病毒載體需要進行病毒包裝,過程更簡單。.

靈活性:根據(jù)使用者的實驗需求,我們的線蟲gRNA表達載體可以搭配不同類型的Cas9使用。

不足之處

基因拷貝數(shù)在不同細胞中呈現(xiàn)差異性:盡管成功的轉(zhuǎn)染可以在單個細胞里產(chǎn)生非常高的拷貝數(shù),但不同細胞間卻有高度的差異性。在一些細胞中,質(zhì)粒拷貝數(shù)非常高,而在另外一些細胞卻是低拷貝甚至沒有。

PAM要求:CRISPR/Cas9靶位點必須包含NGG序列(使用較多),也叫做PAM序列,位于gRNA識別序列3'末端。 

關(guān)鍵元件

CeU6: C. elegans U6 small nuclear RNA promoter. It drives strong expression levels of small RNAs.

gRNA: Guide RNA compatible with the Cas9 variant being used.

Terminator: Pol lll transcription terminator. It allows transcription termination of small RNA transcribed by Pol lll RNA polymerase.

Ampicillin:  Ampicillin resistance gene. It allows the plasmid to be maintained by ampicillin selection in E. coli.

pUC ori:   pUC origin of replication. Plasmids carrying this origin exist in high copy numbers in E. coli.

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